Você precisa adicionar uma string StartupWMClass ao seu arquivo .desktop. Esta é uma string que define em qual classe o aplicativo é agrupado no Iniciador Unity na inicialização.
A solução é adicionar StartupWMClass
ao seu arquivo da área de trabalho. Primeiro você precisa encontrar a classe adequada para sua aplicação.
É explicado aqui (Graças a @chaos ).
Abra sua janela Light Table e digite terminal:
xprop WM_CLASS
Em seguida, clique na janela da Tabela de Vida.
Para o terminal gnome, WM_CLASS deve ser algo como
WM_CLASS(STRING) = "gnome-terminal", "Gnome-terminal"
Assim, todas as janelas com WM_CLASS "gnome-terminal" e "Gnome-terminal" são agrupadas. Para a mesa de luz, você verá uma classe diferente. Escolha um e lembre-se.
Depois de encontrar sua classe de programa, adicione isso ao seu arquivo .desktop:
StartupWMClass=CLASS
Substitua CLASS pela classe do comando anterior.