Abra uma linha de comando / terminal e execute chmod a+x filepath/file.jar
Estou executando o Xubuntu 14.04 e toda vez que tento executar um arquivo .jar, vou para propriedades > permissões, mas não há caixa de seleção para tornar o arquivo executável? Estou usando o Openjdk 6. Eu não vi nenhuma outra pergunta semelhante a esta.
Abra uma linha de comando / terminal e execute chmod a+x filepath/file.jar