É por isso que você deve usar o driver que é distribuído pelos repositórios do Ubuntu. Quando você baixar o driver do site da Nvidia, ele irá modificar o kernel.
A forma como você deve chegar aos drivers nvidia (embora não seja o mais recente) é abrir Software & Updates
do seu Ubuntu Dash, clicar na aba Additional Drivers
e escolher o driver no menu que você deseja. As chances são de que o driver nuveau já esteja instalado, mas se você quiser o driver nvidia proprietário, escolha-o, clique em Apply Changes
e depois e aguarde um pouco.
Uma maneira alternativa de instalar esses mesmos drivers - Abra um terminal e digite
sudo apt-get install nvidia-current
Para a versão testada ou para a versão de ponta (possíveis erros)
sudo apt-get install nvidia-current-updates