Com base nos seus comentários, tenho uma resposta curta.
O comando para iniciar MyEclipse
em um terminal é
/opt/MyEclipse/myeclipse
ou no seu arquivo de área de trabalho
Exec=/opt/MyEclipse/myeclipse
O arquivo completo da área de trabalho
Abra ou crie o arquivo da área de trabalho
nano ~/.local/share/applications/opt_eclipse.desktop
e adicione as linhas abaixo
[Desktop Entry]
Type=Application
Name=MyEclipse
Comment=MyEclipse Integrated Development Environment
Icon=/opt/MyEclipse/icon.xpm
Exec=/opt/MyEclipse/myeclipse
Terminal=false
Categories=Development;IDE;Java;
StartupWMClass=MyEclipse