O sufixo -mt foi removido. As bibliotecas Boost instaladas são multi-threading seguras.
Você pode compilar seu programa em relação a libboost-thread . Quer alterando a fonte para usar não -mt libs ou fazendo links simbólicos libboost_thread.a → libboost_thread-mt.a . A mesma coisa se você precisar de libs compartilhadas .so .