/home está em um sistema de arquivos diferente (a última linha da saída do comando df ) e /mnt/data0 não são exibidos em / , mas estão com 21% de total.
Para que o sistema volte a funcionar, você precisa liberar espaço apenas no sistema de arquivos / , onde também está localizado o diretório /root .
A melhor coisa é verificar onde todo o espaço foi com o comando du -s :
Ou seja:
cd /
du -s *
Em seguida, vá para o diretório com o maior número na frente e digite:
du -s *
E assim por diante. Em algum momento, você encontrará alguns arquivos grandes e poderá optar por removê-los para liberar espaço.