Na verdade, não importa.
Contanto que você não precise mover o Ubuntu ou o Windows, tudo bem.
Basta adicioná-lo onde você tiver espaço livre. :)
Eu tenho um disco rígido extra. Eu não estou configurando dual boot. Eu tenho o Ubuntu no ext4 no início da unidade. e quer colocar uma partição ntfs e um espaço de troca devo colocar espaço de troca entre o Ubuntu e NTFS ou no final da unidade?
Na verdade, não importa.
Contanto que você não precise mover o Ubuntu ou o Windows, tudo bem.
Basta adicioná-lo onde você tiver espaço livre. :)