Você pode fazer isso usando xdotool , mas não é particularmente elegante. Como uma tarefa única, certifique-se de que xdotool esteja instalado:
sudo apt-get install xdotool
Depois, você pode iniciar seu jar da seguinte forma:
TERM_HANDLE='xdotool getwindowfocus'; java -jar maps.jar & sleep 5; xdotool windowactivate $TERM_HANDLE
O xwindow getwindowfocus obtém o identificador de janela atual e o armazena na variável TERM_HANDLE. Então seu java -jar maps.jar & é lançado. Você precisará de um sono até que este comando tenha iniciado (escolha um valor apropriado que funcione para você), antes de usar o xdotool windowactivate para trazer o terminal de volta à frente.