Bem, talvez não seja uma resposta, mas eu queria que você soubesse como fica o meu sistema que estou usando (14.04):
% file -v
file-5.14
magic file from /etc/magic:/usr/share/misc/magic
A única fonte da mágica :) é o arquivo em / etc no meu sistema, pois o outro é um diretório vazio:
% find /usr/share/misc/magic/
/usr/share/misc/magic/
% md5sum /etc/magic
272913026300e7ae9b5e2d51f138e674 /etc/magic
% ls -alh /etc/magic
-rw-r--r-- 1 root root 111 Apr 3 2014 /etc/magic
e retorna o seguinte para muitos dos JPEGs que tenho:
% file *jpg
1Ns3345.jpg: JPEG image data, JFIF standard 1.01
anfffffggsel.jpg: JPEG image data, JFIF standard 1.01
1m32ssQ.jpg: JPEG image data, JFIF standard 1.01
fCWwevC.jpg: JPEG image data, JFIF standard 1.01
SCN_0001.jpg: JPEG image data, EXIF standard
SCN_0002.jpg: JPEG image data, JFIF standard 1.01
SCN_0011.jpg: JPEG image data, EXIF standard
SCN_0012.jpg: JPEG image data, EXIF standard
for7sfe.jpg: JPEG image data, JFIF standard 1.01
Parece que minha mágica é melhor que a sua: D