Encontrei a solução para este problema e continuarei com a forma como resolvi o problema. O problema não foi causado pelo driver Nvidia ou GTK como eu pensava, mas foi devido a um bug antigo no Compiz para fazer com a taxa de atualização de tela em placas Nvidia como apontado por Mateusz Stachowski no Google+ que também forneceu um link para o relatório de erros no launchpad .
O relatório de bug tinha uma correção potencial proposta por Christopher Townsend no número do comentário # 329 em que ele forneceu um link para um PPA para corrigir o bug no Compiz (aparentemente, o patch não pode ser aplicado ao pacote oficial do Compiz devido a problemas de licenciamento).
Para aplicar o patch basta adicionar o PPA ao seu repositório, depois atualizar e reiniciar o sistema.
sudo add-apt-repository ppa:townsend/compiz-nvidia-refresh-test
sudo apt-get update && sudo apt-get dist-upgrade
sudo reboot
Este bug foi corrigido na versão mais recente do Compiz a partir de 1:0.9.11.3+14.04.20150122-0ubuntu1
e o patch acima não é mais necessário para corrigir o problema. Fonte
O pacote oficialmente corrigido pode ser instalado executando:
sudo apt-get update && sudo apt-get install compiz
ou executando uma atualização padrão do Ubuntu com:
sudo apt-get update && sudo apt-get dist-upgrade