Não é assim que o Ubuntu / Linux funciona. Os arquivos que compõem um aplicativo vão para diretórios diferentes em sua raiz. Os binários vão para um diretório bin por exemplo. Portanto, não é aconselhável mover um "aplicativo" para outro disco.
16Gb é MUITO software se contiver apenas software e não seus documentos pessoais. Assumindo que 16Gb também contém seus documentos pessoais, a resposta é muito fácil: mova o conteúdo de suas pastas em / home / $ USER / (ou seja, ~ / Documtents, ~ / Downloads, ~ / Pictures para o segundo disco e crie links simbólicos para / home / $ USER /. Isso vai liberar espaço no seu ssd.
Exemplo, discworld é meu disco rígido. / e / home estão em um ssd. Disposição de disco (sem ramdisks):
$ df -H
Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on
/dev/sda5 99G 7,1G 87G 8% /
/dev/sdb6 365G 204G 143G 59% /discworld
/dev/sdb5 25G 2,3G 21G 10% /home
discworld mantém meus diretórios:
rinzwind@schijfwereld:~$ ls -l /discworld/
total 64
drwxrwxr-x 8 rinzwind rinzwind 4096 dec 17 15:42 Aptana_Studio_3
drwxrwxr-x 9 rinzwind rinzwind 12288 jan 10 23:05 Desktop
drwxrwxr-x 7 rinzwind rinzwind 4096 dec 17 15:42 Documents
drwxrwxr-x 2 rinzwind rinzwind 4096 jan 10 19:51 Downloads
drwx------ 2 root root 16384 apr 6 2013 lost+found
drwxrwxr-x 5 rinzwind rinzwind 4096 apr 21 2014 Music
drwxrwxr-x 2 rinzwind rinzwind 4096 jan 4 01:14 Pictures
drwxr-xr-x 3 rinzwind rinzwind 4096 jan 10 19:12 Steam
drwxrwxr-x 2 rinzwind rinzwind 4096 apr 6 2013 Templates
drwxrwxr-x 3 rinzwind rinzwind 4096 okt 5 12:10 Videos
drwxr-xr-x 4 rinzwind rinzwind 4096 jan 26 2014 VirtualBox VMs
/ home / $ USER /
ls -l
total 12
lrwxrwxrwx 1 rinzwind rinzwind 19 okt 11 20:44 Desktop -> /discworld/Desktop/
lrwxrwxrwx 1 rinzwind rinzwind 21 okt 11 20:45 Documents -> /discworld/Documents/
lrwxrwxrwx 1 rinzwind rinzwind 21 okt 11 20:45 Downloads -> /discworld/Downloads/
-rw-r--r-- 1 rinzwind rinzwind 8980 okt 11 20:40 examples.desktop
lrwxrwxrwx 1 rinzwind rinzwind 20 okt 11 20:45 Pictures -> /discworld/Pictures/
Você pode copiar os diretórios em / home / $ USER / para o diretório / ponto de montagem do segundo disco. E ln -s ~/Desktop /discworld/Desktop
criaria o symlink para "Desktop". Faça o mesmo para os outros e você está pronto para ir.