Isso depende dos seus próprios hábitos de computação. Se você baixar constantemente protetores de tela gratuitos e ponteiros de mouse, provavelmente encontrará um vírus compatível com WINE em pouquíssimo tempo. No entanto, se você mantiver programas livres de malware, estará praticamente seguro. A melhor maneira de garantir que nenhum malware seja instalado é usando exclusivamente o Software Livre ou Open Source Software , pois a tentação de adicionar malware em tais programas é muito menor que Software proprietário , pois há menos chances de conseguir fazê-lo com sucesso.
Por favor, note que rodar um vírus no WINE é muito mais seguro do que rodar o mesmo vírus no Windows, já que o WINE impede que os programas do Windows tenham privilégios de Superusuário, portanto arquivos críticos do Ubuntu não podem ser modificados facilmente. Se você quiser remover um vírus, você pode apagar todo o prefixo WINE (que é o equivalente a limpar toda a instalação do Windows, exceto que ele pode ser removido e reinstalado do zero muito mais rápido), limpando o vírus com isso.