Este é um simples mal-entendido, pois existem muitos tipos de software no centro de software. Há software gratuito e de código aberto, que não é apenas gratuito, mas licenciado sob uma licença de código aberto.
Depois, há softwares disponíveis para comprar, mas geralmente são de código aberto, pois um desenvolvedor pode facilitar o acesso, colocando muito trabalho no centro de software e cobrando pela versão compilada do software.
Depois, há um software proprietário que foi enviado para a "compra" no centro de software, mas os desenvolvedores optaram por não cobrar pelo software "Free", como o custo do dinheiro. No entanto, isso ainda listará "Comprar" e exigirá uma conta do Ubuntu One, mas nenhuma transação monetária ocorrerá.
Erro no Launchpad: link
Porque tenho que 'comprar' um item grátis no Ubuntu Software Center?
Mas não se preocupe, eles não são fraudes.