Use ~ / .fluxbox / startup
Exemplo
/usr/bin/nitrogen --restore &
/usr/bin/xscreensaver &
/usr/bin/start-pulseaudio-x11 &
/usr/bin/xcompmgr -f -c -n -C -F &
# Network manager
nm-applet >/dev/null 2>/dev/null &
#Wicd
wicd-client -n
exec fluxbox
Veja: link
Nos comentários, o tema do fluxbox estava definindo um plano de fundo.
Para depurar esse tipo de problema,
Primeiro verifique ~ / .fluxbox / init e certifique-se de que não há um comando para definir o BG, por exemplo
session.screen0.rootCommand: fbsetbg /path/to/image
Em segundo lugar, verifique seu tema e comente ou exclua as linhas com "plano de fundo", por exemplo,
background: foo
background.color: bar
background.colorTo: bang