Você não poderá fazer nada em nenhuma partição montada e não poderá desmontar a partição que está sendo executada. Então, você precisará inicializar a partir de um live CD ou USB, e então você pode fazer o que quiser no disco, ou reduzi-lo ou apagá-lo.
Mas, se você não se importa com a instalação atual do Ubuntu, não pode simplesmente instalar o Windows e dizer para ele usar o disco inteiro? Eu não estou muito familiarizado com o Windows, então não tenho certeza. Mas eu sei que se você instalar o Windows, ele não preservará o gerenciador de inicialização, então você precisaria saber como restaurá-lo mesmo se você mantivesse o Ubuntu instalado.