Cole o seguinte em um script de shell e faça com que ele seja executado no login:
#!/bin/sh
synclient TapButton1=1
synclient TapButton2=3
synclient TapButton3=2
Isso fará com que um toque com um único dedo toque um clique com um toque de dois dedos, clique com o botão direito e toque com três dedos faça um clique do meio.