Por padrão, na instalação do meu Xubuntu no Mac OS X, fechar a tampa não faz nada. O que você precisa fazer é abrir o menu Whisker (ícone do mouse) e clicar no botão de configurações no canto superior direito. Em seguida, vá para o Power Manager e defina o que você deseja que o Xubuntu faça quando a tampa do laptop estiver fechada na bateria e na AC (você provavelmente a quer suspender para economizar bateria). Isto está assumindo que você está executando o Xubuntu 14.04, se não o Power Manager pode estar em um local diferente.
Assim como uma nota lateral: No meu MacBook Pro 9,2, ele não pode continuar da suspensão depois que ele foi fechado e a tela não liga. Ouvi dizer que era um bug no Xubuntu 14.04, então, até que o bug seja resolvido, certifique-se de pressionar manualmente suspender o botão power no menu whisker antes de fechar a tampa. Então, quando você abrir, pressione uma tecla e ela será retomada normalmente, como se esperasse no meu Mac.