A menos que você seja um fã obstinado desse aplicativo youtube downloader em particular, salve-se do incômodo de configurá-lo no vinho e, como Wilf sugerido, basta pegar um downloader nativo como youtube-dl.
Instruções:
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Abra uma janela de terminal pressionando ctrl + alt + t
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Digite os seguintes comandos para instalar o youtube-dl
sudo add-apt-repository ppa:nilarimogard/webupd8 -y
esudo apt-get update
esudo apt-get install youtube-dl
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Faça o download dos seus vídeos inserindo o seguinte comando em qualquer janela do terminal
youtube-dl http://youtube.com/watch?v=[VIDEO_CODE]
por exemplo,
youtube-dl http://www.youtube.com/watch?v=NxD_kWK8A5M
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Para obter instruções de uso mais avançadas, como o download de vídeos em um formato específico ou o download de vários vídeos de uma vez, veja este artigo .