Não tenho certeza de que funcionaria no github, que pode ter problemas com grandes quantidades de dados armazenados em seus servidores (e, ei, pode até não funcionar). Mas no lado do cliente, você deve dar uma olhada no git-annex:
% bl0ck_qu0te%É de alguma forma possível fazer backup de um servidor inteiro no github a partir da linha de comando?
Algo como:
cd /
git commit username/repos -patch master
Eu sei que pode não ser tão fácil, pois pode ser necessário transformar todo o servidor em um git, e então também requerer um login para o github e assim por diante.
Mas isso é possível? E seria uma boa ou má idéia?