se você estiver usando algum software para conectar-se à Internet, em algum momento, o gerenciador de rede não reconhecerá sua conexão. Então você não poderá instalar softwares através do centro de software.
Eu tive um problema semelhante e resolve quando desabilito o gerenciador de rede, executando este comando no terminal.
sudo stop network-manager
A opção instalar do software center greyed out ficará normal.