A única maneira de desabilitar completamente o IPv6 é colocando o módulo do kernel na lista negra. Coloque a seguinte linha em /etc/modprobe.d/blacklist:
blacklist ipv6
Aviso: O IPv6 está se tornando mais importante a cada dia e o suporte ao IPv6 é assumido por mais e mais softwares atualmente, mesmo que você não o use (ainda) . A lista negra do módulo do kernel pode quebrar coisas.