Se você já configurou o PHPMyAdmin, pode editar o arquivo /etc/phpmyadmin/config.inc.php
e definir o valor $cfg['Servers'][$i]['host']
(e amigos) para o endereço IP ou o nome DNS do servidor MySQL ao qual você está tentando se conectar.
A documentação do PHPMyAdmin é muito boa. Geralmente há um bloco semelhante a:
$cfg['Servers'][$i]['host'] = 'your_server'; // MySQL hostname
$cfg['Servers'][$i]['port'] = '3306'; // MySQL port
$cfg['Servers'][$i]['extension'] = 'mysql';
$cfg['Servers'][$i]['connect_type']= 'tcp';
$cfg['Servers'][$i]['user'] = 'username'; // MySQL user
$cfg['Servers'][$i]['password'] = 'password'; // MySQL password
Você só precisa apontar o valor 'host' para o IP do seu nó MySQL e certificar-se de que a porta TCP 3306 esteja aberta no seu firewall, pelo menos para o seu nó Apache / PHP.