Eu tive o mesmo problema no Amarok.
No meu caso, apenas a tecla play / pause não funciona. O problema está nos atalhos globais do sistema. Eu atribuí outra combinação de chaves em Configurações - > Teclado - > Atalhos para a tecla "Reproduzir (ou reproduzir / pausar)"
A seguir, a tecla reproduzir / pausar começa a funcionar no Amarok.
Certifique-se de que o atalho global para o Amarok tenha sido atribuído (veja como: Como ligar a tecla play / pause ao Amarok? )