A solução para mim foi instalar o "pavucontrol", Pulse Audio Volume Control.
sudo apt-get install pavucontrol
Após a instalação, vá para Dispositivos de Entrada e pressione o ícone de Bloqueio que bloqueia o nível do canal juntos. Então, configurei o Right para 50% e deixei para 25%, o que no meu caso me deu um som muito claro. Eu testei com meu PC de mesa no Skype e no Hangouts.
Oproblemaéchamadode"Mic invertido", e parece que ter 2 canais no mesmo nível faz com que eles se anulem mutuamente [Preciso citar aqui lol]
Eu também desativei a opção de gravação chamada "Monitor", mas isso não foi necessário.
Existe outro separador, que mostra os programas que estão atualmente a utilizar o dispositivo de gravação, pelo que poderá ter de editar as definições se o primeiro passo não funcionar bem.
Outra coisa que eu notei é que o Google Hangouts estava modificando as configurações, então eu tive que modificar suas configurações:
cd ~/.config/google-googletalkplugin # get to google chat's directory
cp -p options options.bak # make a backup before changing stuff !
gedit options # edit the config file
agora altere uma das linhas para que seja lida da seguinte forma:
audio-flags=1
Origem do problema do Hangouts: link