Encontrou o problema.
Por algum motivo, os problemas de localidade estavam causando isso. Ao tentar executar o r do terminal, havia alguma mensagem de erro relacionada ao código do idioma, portanto, acabei de gerar e reconfigurar um novo, conforme descrito aqui:
Como corrijo meu problema de localidade?
De repente, o RStudio estava funcionando bem.