Diga apenas paste
para não adicionar nenhum caractere delimitador, se seus arquivos já tiverem o espaçamento necessário
$ paste -d '' a b c
ATOM 1149 N MET B 1 -16.392 -20.171 -30.339 1.00140.13 N
ATOM 1150 CA MET B 1 -15.456 -21.035 -31.092 1.00140.13 C
ATOM 1151 C MET B 1 -14.468 -20.202 -31.838 1.00140.13 C
ATOM 1152 O MET B 1 -13.272 -20.492 -31.837 1.00140.13 O
ATOM 1153 CB MET B 1 -16.220 -21.911 -32.099 1.00140.13 C
ATOM 1154 CG MET B 1 -16.929 -21.120 -33.199 1.00140.13 C