Sim, o Windows gosta de estar na primeira partição porque é complicado. Você pode particionar seu disco rígido com o Gparted, por exemplo, instalar janelas e reinstalar o bootloader grub, mas isso é confuso e eu não seria o melhor explicando como isso funciona, infelizmente.
Mas, para responder à sua pergunta, sim, o Windows tentará substituir o Ubuntu.
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Embora se win7 está na primeira partição, não, desculpe, eu não pensei nisso no meu primeiro comentário. Peço desculpas. Você tem o disco win8? se você não fizer nenhum mal colocando-o e testando, apenas não concorde com o formato, é claro, se ele sugerir isso.