A redução de uma partição do Windows é trivial usando o Gerenciamento de Disco. Você pode criar uma nova partição para armazenar os arquivos que deseja manter. Um backup de seus dados é altamente recomendado antes de mexer nas partições, a menos que você não se importe de perder seus dados.
Depois que o Ubuntu for instalado e os dados forem copiados da partição B, você poderá usar o gparted para excluir a segunda partição e expandir a partição A para preencher o disco inteiro.