Uma instalação do ubuntu verdadeira (prática e usável) (não é um disco ativo) não pode ser feita em uma unidade flash (mas pode ser bastante difícil de ser feita e totalmente funcional) Você pode instalar o ubuntu em um disco rígido externo (você pode comprá-los por 25 dólares, porque a capacidade não precisa ser tão grande).
A primeira coisa que você faz (opcional, mas pode lhe poupar o trabalho de consertar o disco do Windows se cometer algum erro) é desconectar o disco rígido interno (não é tão difícil, apenas retire o cabo).
Em seguida, basta instalar o ubuntu no disco rígido externo.
Reconecte seu disco rígido interno.
Altere sua configuração de inicialização para que o usb tenha prioridade de inicialização e pronto
Agora eu tenho que notar que, a menos que você tenha o usb 3.0 ou e-sata, ele pode ficar um pouco lento, mas não tanto, para torná-lo inutilizável. Eu tive alguns bons resultados com uma porta usb da BM no passado.
Se você realmente quiser usar uma unidade flash, eu recomendaria usar uma versão ao vivo e manter cerca de 500mb para um gig de espaço "utilizável" disponível. Você pode definir esse espaço "utilizável" usando o Unetbootin simplesmente aumentando o espaço para arquivos do usuário. O Unetbootin está disponível nos repositórios e no centro de software do Ubuntu.
Para instalar a partir do Terminal, use
sudo apt-get install unetbootin