O problema de renderização da tela foi resolvido instalando o pacote fglrx
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Parece que não resolveu todo o tremeluzir, mas certamente reduziu-o.
Eu estou rodando 13.10 com o Gnome-Fallback e uma Trinity Radeon HD 7540 e estou piscando (entre objetos individuais - não a tela inteira), regiões de tela sendo aleatoriamente sombreadas (pelo menos no Firefox e no LibreOffice Calc) e falhas de desenho de objeto (a grade em um documento do Calc). Esses problemas podem ser reproduzidos de forma confiável.
O problema de renderização da tela foi resolvido instalando o pacote fglrx
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Parece que não resolveu todo o tremeluzir, mas certamente reduziu-o.