Como mencionado no site do Ubuntu One, você tem a possibilidade de restaurar arquivos excluídos:
Em outubro de 2013, você também tem uma maneira de recuperá-los do servidor: Em seu perfil do Ubuntu One na web, você pode escolher a opção "Recuperar arquivos excluídos". Isso iniciará um trabalho que recuperará os arquivos excluídos e os colocará em uma pasta chamada "Recovered", seguida da data da recuperação.
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Mas não há possibilidade de impedir a exclusão da nuvem.