Eu finalmente terminei com uma instalação regular do Ubuntu em vez de Wubi.
O problema pode ter sido de alguma forma relacionado à minha unidade de CD / DVD. Eu fiz uma mídia USB inicializável e tudo funcionou perfeitamente. Agora só vejo o GRUB (listando o Ubuntu e o Windows 7), portanto, isso é mais simples do que a configuração anterior usando o líder de inicialização do Windows, seguido pelo GRUB. Ambos os sistemas operacionais são carregados corretamente e todos os aplicativos do Windows que usam sistemas de licenciamento em rede ainda são executados.