Experimente scrot . Está disponível no Centro de Software.
Ele tem muitos recursos, mas se você quiser apenas fazer uma captura de tela, invoque scrot e um arquivo de imagem será salvo no diretório atual.
Eu costumava usar o comando "snapshot" para capturar capturas de tela no ambiente Linux Redhat. Existe o mesmo comando ou similar com o Ubuntu 12.04 LTS?