Parece que as permissões no seu arquivo de opções foram configuradas incorretamente. Você pode navegar até o arquivo /home/<USERNAME>*/.config/gedit (Vá para a pasta oculta .config
e clique com o botão direito do mouse na pasta gedit e selecione propriedades no menu suspenso) e certifique-se de que as permissões estão definidas da seguinte forma: **** (troque seu nome de usuário por < USERNAME >) ***
Se eles não se parecem com isso, me avise e vamos resolver isso.