A página que você listou está ligando ao código-fonte, que você não pode instalar usando o apt-get. No entanto, o número da versão do skipfish no seu link é 2.10b-1, que está disponível no repositório do universo do Ubuntu 13.04, você também pode fazer o download manualmente do .deb aqui: link e se você clicar duas vezes nele deverá ser solicitado a abrir com o ubuntu software center, que você pode usar para instalá-lo .