Como outros disseram, pode ser que você tenha definido o seu live usb no modo de persistência quando você o fez. Alguns criadores de conteúdo usb dificultam ver graficamente se o modo de persistência está ativado ou não.
Eu prefiro o Linux Live USB criador tanto quanto aparência e facilidade de uso, também é muito fácil ter certeza de que você não está no modo de persistência ao fazer o seu USB ao vivo. No entanto, o UNetBootin é definitivamente melhor quando se trata de compatibilidade com o Linux Distro. Eu não sei qual USB você está usando, mas se você está fazendo um 13.04 usb, eu recomendo o Linux Live USB creator.
Linux Live:
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UNetBootin:
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Certifique-se de que, quando você cria seu Live usb para formatá-lo, os dois criadores têm a opção de fazer isso durante o processo. Isso também deve garantir que você tenha o espaço livre extra que está perdendo.
Espero que isso ajude, boa sorte!