Para instalar o Nautilus, apenas pressione Ctrl + Alt + T no seu teclado para abrir o Terminal. Quando se abre, execute o (s) comando (s) abaixo:
sudo add-apt-repository ppa:gnome3-team/gnome3
sudo apt-get update
sudo apt-get install nautilus
Você pode executar este comando no Terminal para mostrar o aplicativo padrão da pasta:
xdg-mime query default inode/directory
Em seguida, faça isso para tornar o Nautilus o gerenciador de arquivos padrão
xdg-mime default nautilus.desktop inode/directory application/x-gnome-saved-search
xdg-open $HOME
Para instalar o Nemo File Manager no Ubuntu por si só, pressione Ctrl + Alt + T no seu teclado para abrir o Terminal. Quando se abre, execute o (s) comando (s) abaixo:
sudo add-apt-repository ppa:gwendal-lebihan-dev/cinnamon-stable
sudo apt-get update
sudo apt-get install nemo
Instale plugins extras para o Nemo File Manager, primeiro adicione o PPA acima e instale:
sudo apt-get install nemo-compare nemo-dropbox nemo-fileroller nemo-pastebin nemo-seahorse nemo-share
Fonte: Atualizações do Ubuntu