Bem, eu tenho um laptop com uma configuração similar (uma nvidia discreta gpu em vez de amd) e usado para enfrentar os mesmos problemas de resfriamento que você até eu começar a usar o TLP, que é uma ferramenta de gerenciamento de energia para linux. Aqui estão os passos para resolvê-lo: link
Eu também uso bumblebee que ajudou a reduzir meus tempos ociosos. por cerca de 5-7 graus, embora seja apenas para laptops nvidia optimus. Tenho certeza de que há uma ferramenta semelhante para gráficos comutáveis.