Suponho que você queira que o script seja executado no lado do cliente. (Para o lado do servidor, você teria que usar o php, como mencionado em um dos comentários).
Se você estiver usando o Firefox, você tem que escrever isso como um complemento. Note que funções javascript simples são executadas em uma caixa sand, então fazer um add-on se torna essencial para você.
Costumava haver add-ons que poderiam executar qualquer script bash para você. Fonte
Você pode encontrar este link relevante para começar a escrever em.