Não. Você só poderá executar um sistema operacional no momento ... Sua CPU ficará bem. Atualmente, estou inicializando meu dual-core Centrino sem nenhum problema.
Tudo isso só conta se você não usa o VMWare ou outras máquinas virtuais ... Executar dois sistemas operacionais com o segundo sistema operacional em execução em uma VM certamente afetará a velocidade da sua CPU ...