Eu não sei sobre o multimonitor, mas se você quiser atualizar seus drivers de catalisador eu sugiro que você use o método de repositório em vez do amd-installer.
Especificamente:
1) remova o ubuntu fglrx que está atualmente instalado:
sudo apt-get autoremove --purge fglrx*
sudo rm /etc/X11/xorg.conf
e reinicie.
2) Adicione o ppa xorg-edgers e instale o catalisador de drivers mais recente 13.2 (beta7):
sudo add-apt-repository ppa:xorg-edgers/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install fglrx
sudo aticonfig --initial
e reinicie.
Se você está em uma instalação do ubuntu verdadeira 12.04.2 e, portanto, executando o kernel Quantal e o xorg, você pode deixar o ppa em seu sistema e, a partir de agora, o driver irá atualizá-lo automaticamente. Se você está usando o kernel preciso 3.2.xx, você deve remover o ppa antes da reinicialização final, porque ele irá quebrar o seu sistema durante a próxima atualização do apt-get.
Para isso, basta dar o comando:
sudo add-apt-repository --remove ppa:xorg-edgers/ppa
sudo apt-get update
você pode adicionar o repositório novamente na próxima vez que quiser atualizar seus drivers.