hmmm .... Eu acho que confira suas configurações de energia, possivelmente até mesmo na sua bios, mas provavelmente no Linux. Certifique-se de que está monitorando ativamente os tempos e controlando a velocidade e o resfriamento dos ventiladores.
É possível que um controlador de vídeo ou seu chipset ou algo não esteja usando o driver correto no linux. Se este for o caso, eu diria que comece indo para fontes de software no Ubuntu e vendo o uso de drivers de vídeo diferentes (como para placas NVidia, há pelo menos cinco fontes diferentes para drivers e apenas um ou dois deles são NVidia).
Um driver de chipset pode fazer sentido, pois é nesse ponto que seu gerenciamento de energia tende a ocorrer. É possível que o seu Acer possa requerer drivers proprietários para seus recursos de gerenciamento de energia.