Isso parece ser um bug no Lubuntu 13.04, eu tenho tido o mesmo desde que eu atualizei. Para mim isso acontece ocasionalmente, informando que há "outro (s) usuário (s) logado (s) no sistema". Essa é a mesma mensagem que você está recebendo?
Eu suspeito que há um link com um trabalho find cron que é executado pelo usuário 'nobody', aproximadamente diariamente. Dado que começou com 13.04, pode ser indexação de busca para o novo recurso de busca do PCManFM. Infelizmente, isso tornaria um erro genuíno do Lubuntu, em vez de um problema facilmente corrigível - o que significa que ele deve ser reportado no bugtracker do Lubuntu.
(Postado como resposta porque não consegui comentar como comentar a questão)