O sistema reconhecerá a partição e não tentará usá-la como partição swap.
O uso pode criar um arquivo de troca em uma partição. Há um bom guia aqui: link
(Eu estou querendo saber btw - por que você precisa de uma partição primária extra? Por que você não pode usar uma partição estendida?)
Se você precisar de mais de 4 partições, o melhor método é tornar a sua 4ª partição Partição Estendida (tão grande quanto você possa precisar) e criar muito mais Partições Lógicas sob ele.