Eu acho que seu segundo comando está errado. Eu tentei:
/home/users/myuser/myfolder/myjarfile.jar
e funciona. Se eu tentar:
./home/users/myuser/myfolder/myjarfile.jar
Recebo uma mensagem de erro:
zsh: datei oder Verzeichnis nicht gefunden: ./home/users/myuser/myfolder/myjarfile.jar
que significa que o arquivo não foi encontrado.
O terceiro comando também está errado. Experimente java -jar /home/users/myuser/myfolder/myjarfile.jar