Acho que seu link está errado, tente este aqui
deb http://cran.at.r-project.org/bin/linux/ubuntu precise/
Quando a atualização falha, recebi esta mensagem:
W:Failed to fetch http://cran.at.r-project.org/dists/precise-backports/main/source/Sources 404 Not Found
E:Some index files failed to download. They have been ignored, or old ones used instead.
Acho que seu link está errado, tente este aqui
deb http://cran.at.r-project.org/bin/linux/ubuntu precise/