O instalador do Ubuntu não vê nenhum sistema operacional no (s) seu (s) disco (s) rígido (s); assim, ele aconselhará formatar o disco (limpe o disco e formate-o para ext4 se você escolher ext4). disco para instalar o Ubuntu.
Somente se você quiser salvar qualquer coisa que esteja atualmente no disco, talvez queira fazer o backup; mas como você disse: ainda não há sistema operacional.
Então, nada para se preocupar:)