Eu não tive problemas em executá-los ao lado uns dos outros. Você selecionará em qual ambiente deseja fazer login na tela de login na inicialização clicando nesse pequeno círculo branco. Supondo que você não tenha outros ambientes instalados, a lista deve consistir apenas em "Ubuntu" e "Ubuntu 2d". Quando você instala o KDE, verá os dois ambientes "Ubuntu" e o espaço de trabalho do KDE Plasma. Clique na opção KDE e digite sua senha e você estará pronto para começar.
Um efeito colateral de fazer isso é que você terá programas de ambos os ambientes listados. Por exemplo, você pode ter o gedit, assim como a lista do editor de texto do kde em programas. Você também pode ter o gerenciador de configurações do KDE e o gerenciador de configurações da unidade listados, o que pode ser confuso. Além disso, não tive problemas em executar o KDE, o mate, o gnome, o xfce e a unidade na mesma máquina.
Na verdade, agora estou usando uma nova instalação do xubuntu com o Unity instalado! Tudo funciona bem.
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