O problema pode ser sua placa gráfica consumindo mais energia. Eu tive um problema semelhante e instalei o Bumblebee. Agora eu recebo aprox. 2 horas da vida da bateria e 65 ° C temp. (em uso prolongado).
Veja também: Como faço para ativar / desativar a placa gráfica à vontade sem sair?