A melhor maneira e mais difícil para qualquer intruso é usar o LVM e uma chave USB separada para armazenar os dados-chave para a descriptografia automática.
Esta resposta é muito parecida com o que eu pedi
Mas há outras maneiras de conseguir o que eu preciso sem uma chave USB separada, mas ressaltei que é muito fácil sequestrar o grub e inicializar no root com acesso total.